《虐殺器官 GENOCIDAL ORGAN》由ShūkōMurase執導和創作並由Manglobe製作的動畫電影改編本定於2015年11月13日發行。但是，由於Manglobe的破產，該電影的發行被推遲了。後來於2015年11月13日宣佈，該電影的製作已在新創建的Geno Studio下由同一工作人員恢復，並希望在2016年底前完成該電影。該電影於2017年2月3日上映。在日本電影上映之前，2016年10月31日在2016年東京國際電影節上放映了前15分鐘。Funimation於2017年7月12日至13日在美國部分劇院上映了這部電影。

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塞拉耶佛發生一場突如其來的核爆，造成地球表面產生了一個巨大坑洞，幾個曾經被神祕公司援助過的國家竟然因此發生了大規模的暴動與屠殺事件。而美國特殊情報部隊的克拉維斯，在追查這些腥風血雨的同時，發現一名神祕的美國人約翰‧保羅疑似參與其中，也意外地得知「虐殺器官」的存在，因而開始找尋真相……。